Le Koi, come tutti i pesci, hanno bisogno di un efficiente processo di respirazione a causa di una minore quantità di ossigeno presente nell’acqua ed una variabile pressione parziale dell’ossigeno
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Il sistema circolatorio delle Koi è formato da tre elementi principali: il cuore, il sistema vascolare, il sangue.
Le branchie delle Koi, come tutti i pesci moderni, sono formate da quattro archi branchiali respiratori e cinque archi non respiratori per ogni parte della cavità orale.